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/ Aminet 6 / Aminet 6 - June 1995.iso / Aminet / misc / sci / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00650 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  922 b   |  23 lines
  1. ***********************************
  2. * Ribosomal protein L36 signature *
  3. ***********************************
  4.  
  5. Ribosomal protein L36  is the smallest protein from  the large  subunit of the
  6. prokaryotic ribosome. It  belongs to a family of  ribosomal proteins which, on
  7. the basis of sequence similarities [1], groups:
  8.  
  9.  - Eubacterial L36.
  10.  - Algal and plant chloroplast L36.
  11.  
  12. L36 is a small basic and cysteine-rich protein of 37 amino-acid residues. As a
  13. signature   pattern,  we  selected  a  conserved region  that  corresponds  to
  14. positions 11 to 27 in L36 and includes three conserved cysteine residues.
  15.  
  16. -Consensus pattern: C-x(2)-C-x-[LIVM](2)-x-R-x(3)-[LIVM]-x-[LIVM]-x-C
  17. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  18. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  19. -Last update: June 1994 / Text revised.
  20.  
  21. [ 1] Otaka E., Hashimoto T., Mizuta K.
  22.      Protein Seq. Data Anal. 5:285-300(1993).
  23.